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Real-time qPCR技術(shù)的定量原理：

一、擴增曲線

在Real-time qPCR中，對整個PCR反應(yīng)擴增過程進行了實時的檢測并記錄其熒光信號，隨著反應(yīng)的進行，監(jiān)測到的熒光信號可以繪制成一條曲線，即為擴增曲線。

熒光擴增曲線一般分為基線期、指數(shù)增長期和平臺期。

在Real-time qPCR擴增早期，擴增的熒光信號被熒光背景信號所掩蓋，無法判斷產(chǎn)物量的變化，此時即為基線期。

PCR反應(yīng)過程中產(chǎn)生的DNA拷貝數(shù)是呈指數(shù)形式增加的，隨著反應(yīng)循環(huán)數(shù)的增加，最終PCR反應(yīng)不再以指數(shù)形式生成模板，從而進入“平臺期"。在該時期，擴增產(chǎn)物已不再呈指數(shù)級的增加，PCR的終產(chǎn)物量與起始模板量之間無線性關(guān)系，所以根據(jù)最終的PCR產(chǎn)物量不能計算出初始模板量。

只有在熒光信號的指數(shù)增長期，PCR產(chǎn)物量的對數(shù)值與起始模板量之間存在線性關(guān)系，可以選擇在這個階段進行定量分析。

                                                                 擴增曲線和Ct值

二、熒光閾值

為了便于對所檢測樣本進行比較，首先需設(shè)定一個熒光信號的閾值，熒光閾值是在擴增曲線上人為設(shè)定的一個值，它可以設(shè)定在指數(shù)擴增階段任意位置上，一般熒光閾值設(shè)置為3～15個循環(huán)的熒光信號的標準偏差的10倍，但實際應(yīng)用時要結(jié)合擴增效率、線性回歸系數(shù)等參數(shù)來綜合考慮。

通常熒光閾值都是Real-time qPCR儀器自動設(shè)置，如無特殊情況，無需更改。

三、循環(huán)閾值

循環(huán)閾值 (Cycle threshold valve, Ct) 即Real-time qPCR擴增過程中擴增產(chǎn)物的熒光信號達到設(shè)定的熒光閾值時所經(jīng)過的擴增循環(huán)次數(shù)，Ct值與熒光閾值有關(guān)。

一般Ct值位于指數(shù)增長期的開始階段，此時樣品間細小物差尚未放大且擴增效率也相對恒定，因此該Ct值具有重復(fù)性，盡管平臺期的DNA拷貝數(shù)波動很大，Ct值卻是相對固定的。